Program Studi S-1 Akuntansi, Universitas Fajar, berdiri sejak adanya penggabungan Sekolah Tinggi Ilmu Komunikasi (STIKOM) Fajar, Akademi Pariwisata (AKPAR) Fajar, dan Akademi Akuntansi Fajar di Makassar yang akhirnya menjadi Universitas Fajar di bawah naungan Yayasan Pendidikan Fajar Ujung Pandang. Universitas Fajar resmi mendapat ijin operasional berdasarkan keputusan Menteri Pendidikan dan Kebudayaan RI No. 132/D/O/2008. Berlokasi di Jalan Racing Center No. 101, Makassar, Universitas Fajar memiliki beberapa fakultas, mulai dari Fakultas Pascasarjana, Fakultas Teknik, serta Fakultas Ekonomi dan Ilmu-Ilmu Sosial. Program Studi Akuntansi sendiri dibawahi oleh Fakultas Ekonomi dan Ilmu-Ilmu Sosial.
Sebagai bentuk evaluasi diri dan upaya perbaikan berkelanjutan dalam penyelenggaraan suatu program studi, maka Program Studi S-1 Akuntansi mengajukan penilaian pengelolaan program studi kepada Badan Akreditas Nasional Perguruan Tinggi (BAN-PT). Berdasarkan keputusan BAN-PT Nomor: 1207/SK/BAN-PT/Akred/S/VII/2016, program studi S-1 Akuntansi, Universitas Fajar, dinyatakan terakreditasi dengan peringkat Akreditasi B (Baik).